Programy: Medziakademická dohoda (MAD)
Život a smrť v neolitických a eneolitických komunitách v strednom Podunajsku (Life and death of Neolithic and Aeneolithic communieties in middle Danube)
Zodpovedný riešiteľ: PhDr. Ivan Cheben, CSc.
Trvanie projektu: 1.1.2013 – 31.12.2015
Archeológia Polska a Slovenska od sklonku antiky do vrcholného stredoveku (Archaeology of Poland and Slovakia from late antiquity to the High Middle Ages )
Zodpovedný riešiteľ: PhDr. Peter Šalkovský, DrSc.
Trvanie projektu: 1.8.2013 – 31.12.2015
Programy: Medziústavná dohoda
Dohoda o vedeckej spolupráci – Oxford Radiocarbon Acceleration Unit (Research Laboratory for Archaeology and the History of Art) 
Zodpovedný riešiteľ: PhDr. Klaudia Daňová, PhD.
Trvanie projektu: 1.9.2015 – 31.08.2020
Anotácia: Strategickým cieľom dohody je zjednotenie úsilia spolupracovníkov oboch inštitúcií v oblasti výskumu a rozšírenia človeka, dávnych kultúr, tradícií a inovácií v Európe. Štúdium materiálu, AMS radiokarbonové datovanie, zber a analýza vzoriek DNA a spolupráca v oblasti archeológie praveku a staršej doby bronzovej.
Zmluva o vzájomnej spolupráci (Agreement on co-operation)
Zodpovedný riešiteľ: PhDr. Kristián Elschek, CSc.
Trvanie projektu: 1.1.2009 – 9.8.2019
Zmluva o vedeckej spolupráci – Slezská univerzita Opava
Zodpovedný riešiteľ: doc. PhDr. Matej Ruttkay, CSc.
Trvanie projektu: 1.3.2015 – 31.12.2018
Anotácia: Spolupráca pri sprístupňovaní výsledkov vedy formou organizovania spoločných odborných konferencií, seminárov, pracovných stretnutí a výstav, ako aj publikovania odborných štúdií a recenzií v periodikách partnerskej inštitúcie.
Zmluva o vzájomnom vysielaní na vedecké pobyty – Europäisches Burgeninstitut Braubach
Zodpovedný riešiteľ: PhDr. Peter Bednár, CSc.
Trvanie projektu: 1.4.2015 – 31.12.2018
Anotácia: Študijné a pracovné pobyty vedeckých a odborných pracovníkov na pracoviskách partnerskej inštitúcie
Zmluva o vzájomnom vysielaní pracovníkov na vedecké pobyty – Instytut Archeologii Uniwersytetu Jagiellońskieho, Kraków
Zodpovedný riešiteľ: doc. PhDr. Matej Ruttkay, CSc.
Trvanie projektu: 1.3.2015 – 31.12.2018
Anotácia: Podpora a realizovanie študijných a pracovných pobytov odborných a vedeckých pracovníkov na pracoviskách partnerskej inštitúcie.
Zmluva o vzájomnom vysielaní pracovníkov na vedecké pobyty – Ústav archeologické památkové péče, v.v.i. Brno
Zodpovedný riešiteľ: doc. PhDr. Matej Ruttkay, CSc.
Trvanie projektu: 1.3.2015 – 31.12.2018
Anotácia: Financovanie jednotlivých pobytov sa uskutoční po vzájomnej dohode a podľa možností pozývajúcej strany. Dĺžka študijných pobytov jednotlivých pracovníkov neprekročí dobu 2 mesiacov.
Rámcová zmluva o poskytovaní služieb – AMS 14C datovanie archeologických vzoriek – Foundation of the A. Mickiewicz University
Zodpovedný riešiteľ: doc. PhDr. Matej Ruttkay, CSc.
Trvanie projektu: 1.10.2015 – 31.12.2018
Anotácia: Predmetom zmluvy je záväzok poskytovateľa poskytnúť objednávateľovi služby v rámci zákazky AMS 14C datovanie archeologických vzoriek.
Transkarpatské spoločensko-kultúrne pomery obyvateľstva badenskej kultúry v povodí hornej Visly a na slovenskom území severného Potisia (3300-2900 BC) (Trans-Carpathian cultural relations of the Baden Culture from areas of the Lesser Poland and Eastern Slovakia (3300-2900 BC).)
Zodpovedný riešiteľ: PhDr. Eva Horváthová, PhD.
Trvanie projektu: 1.3.2014 – 31.12.2016
Dohoda o spolupráci – Régészeti Intézet, Magyar Tudományos akadémia
Zodpovedný riešiteľ: Doc. PhDr. Matej Ruttkay, CSc.
Trvanie projektu: 1.1.2010 – 31.12.2015
Dohoda o spolupráci – Uniwersytet Jegielloński, Instytut archeologii, Kraków
Zodpovedný riešiteľ: Doc. PhDr. Matej Ruttkay, CSc.
Trvanie projektu: 1.1.2014 – 31.12.2018
Zmluva o vedeckej spolupráci – Archeologický ústav AV ČR Praha, v.v.i.
Zodpovedný riešiteľ: Doc. PhDr. Matej Ruttkay, CSc.
Trvanie projektu: 1.1.2014 – 31.12.2018
Zmluva o vedeckej spolupráci- Archeologický ústav AV ČR Brno, v.v.i.
Zodpovedný riešiteľ: Doc. PhDr. Matej Ruttkay, CSc.
Trvanie projektu: 1.1.2014 – 31.12.2018
Zmluva o vzájomnom vysielaní pracovníkov na vedecké pobyty – Archeologický ústav AV ČR Brno, v.v.i.
Zodpovedný riešiteľ: Doc. PhDr. Matej Ruttkay, CSc.
Trvanie projektu: 1.1.2014 – 31.12.2018
Programy: COST
COSCH – Farba a miesto v kultúrnom dedičstve (COSCH – Colour and Space in Cultural Heritage)
Zodpovedný riešiteľ: Doc. PhDr. Matej Ruttkay, CSc.
Trvanie projektu: 1.1.2012 – 31.12.2015
Evidenčné číslo projektu: oc-2011-2-10516
Organizácia je koordinátorom projektu: nie
Koordinátor: Fachhochschule Mainz – University of applied Sciences
Počet spoluriešiteľských inštitúcií: 57
Programy: Culture 2000
Archeologické krajiny Európy (Archaeolandscapes Europe)
Zodpovedný riešiteľ: Ing. Elena Blažová
Trvanie projektu: 15.9.2010 – 14.9.2015
Evidenčné číslo projektu: 2010 – 1486/001-001
Organizácia je koordinátorom projektu: nie
Koordinátor: Roman-Germanic Commission German Archaeological Institute
Počet spoluriešiteľských inštitúcií: 25
Programy: Bilaterálne – iné
Dohoda o spolupráci – Eötvös Loránd Tudományegyetem, Budapest
Zodpovedný riešiteľ: PhDr. Ján Beljak, PhD.
Trvanie projektu: 1.7.2014 – 31.12.2018
Organizácia je koordinátorom projektu: áno
Počet spoluriešiteľských inštitúcií: 4
Kniežacia hrobka z Popradu-Matejoviec (Chieftain grave from Poprad-Matejovce)
Zodpovedný riešiteľ: PhDr. Karol Pieta, DrSc.
Trvanie projektu: 1.9.2010 – 31.5.5015
Organizácia je koordinátorom projektu: áno
Počet spoluriešiteľských inštitúcií: 1
Programy: Iné
Archeologický výskum pravekých montánnych objektov na ťažbu v Španej Doline – Deutschen Bergbau-Museum Bochum
Zodpovedný riešiteľ: PhDr. Ivan Cheben, CSc.
Trvanie projektu: 1.1.2015 – 31.12.2016
Zisťovanie proveniencie (pre)historických kultúrnych zvyškov v regióne Slovenska na základe elementálnych a izotopických prvkov (Investigation of provenance of (pre)historic cultural remains in the Slovak region by elemental and isotopic fingerprints)
Zodpovedný riešiteľ: Doc. PhDr. Matej Ruttkay, CSc.
Trvanie projektu: 1.12.2013 – 31.12.2016
Organizácia je koordinátorom projektu: áno
Počet spoluriešiteľských inštitúcií: 1
Sídliskové výskumy na juhozápadnom Slovensku od neolitu do doby bronzovej/Siedlungskundliche Forschungen in der Südwestslowakei vom Neolithikum bis zur Bronzezeit
Römisch-Germanische Kommission des Deutschen Archäologischen Institut
Zodpovedný riešiteľ: prof. PhDr. Jozef Bátora,DrSc.
Trvanie projektu: 1.1.2016 – 31.12.2017
Anotácia: Archeologické práce sa uskutočnia vo Vrábľoch a okolí, Budú predstavovať terénne výkopové práce, povrchový prieskum a prospekciu. Súčasne sa bude spracovávať a dokumentovať nálezový materiál. Metodické postupy sa dohodnú spoločne.
Fidvár bei Vráble – eine Siedlung an der Schnittstelle der alteuropäischen Metallurgieprovinzen. Interkulturelle Dynamik und Umweltveränderungen an einer landschaftsökologischen Schlüsselregion im östlichen Zentraleuropa.
Zodpovedný riešiteľ: Prof. PhDr. Jozef Bátora, DrSc.
Trvanie projektu: 1.9.2011 – 31.8.2015
Organizácia je koordinátorom projektu: áno
Počet spoluriešiteľských inštitúcií: 1
Výskum v Mýtnej Novej Vsi na Ponitrí v roku 2014
Zodpovedný riešiteľ: Prof. PhDr. Jozef Bátora, DrSc.
Trvanie projektu: 1.8.2014 – 31.8.2014
Organizácia je koordinátorom projektu: áno
Počet spoluriešiteľských inštitúcií: 1